在物流过程中各种自然因素(温度、湿度、日照、有害物质、生物等)对产品的质量发生的影响，会使产品损坏、变质。因此在物流体系中木制包装箱主要的功能就是保证产品在从出厂起，经运输、贮存、装卸最终送到用户手中为止的全过程得到保护。我们知道天然木材制造的木箱包装外观漂亮、结实耐用、有一定的弹性、能承受冲击和振动，而且木材本身就具有一定的有一定的防腐蚀功效，对环境变化的影响如高温、低温、潮湿、低气压、降水等，化学活动性物质的腐蚀：海水、二氧化硫、氨气、盐酸等，以及生物侵入的破坏:霉菌、昆虫、啮齿类动物等起到阻隔的防护商品品质不被腐蚀的防护作用。
整个物流过程不论流通环节多么复杂，它总是由装卸、运输和储存三个基本环节组成的。设计合理品质优良的木制包装箱完全可以维持产品在物流过程中的完整性，木制包装箱设计可以根据产品的特性和保护要求而选择合理的包装材料、包装技术、缓冲设计、包装结构、尺寸、规格等要素，对产品进行科学的包装设计、避免各种外界不良因素对产品的影响。应对在装卸搬运、运输过程中受到撞击、震动对产品带来的危害实行有效的保护。
木制包装箱的结构由底部底盘、四周的墙板与顶部盖板6大块组成。墙板的设计，除了必须符合客户的要求如对面板材料的要求，还必须考虑到货物的固定性，包装货物运输装卸过程中完好无损，选取一定厚度的胶合板作为木制包装箱的墙板材料。盖板厚度的选择，了解客户的需求，看看木制包装箱是否需要堆叠，如果在运输和仓储过程中，包装箱需要每层堆叠，要加厚盖板的厚度，确保能够承受堆叠的重量。
最后是底盘的设计，这也是最重要的一步，因为木制包装箱设计精华在结构合理的底盘，底部的木质托盘设计，货物的重量决定木制包装箱底座结构设计，现在大多数货物都是用叉车进行装卸，如果无法叉车装卸时用吊车，需要考虑卸载工具的多样性。所以木箱包装工程师-彭百桂经理郑重提醒，为了确保产品质量性能不受影响，发挥木制包装箱的最大功效，在包装箱投入使用时，一定要做好底盘的设计。
结构合理的包装箱底盘可以保护商品从出厂到消费整个过程不致损坏、散失，对于外力作用的破坏：冲击、跌落、振动、摇摆等起到保护。最后就是制作加工工艺节，如果要保证木制包装箱投人使用时能执行其预定的功能，就需要牢固的底盘结构，如果木制包装箱的各方面性能达不到产品需要的防护和保护需求，产品就有可能在流通过程中损坏。因此木制包装箱设计与精良的加工工艺同样重要。
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